牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)病pcr快速診斷試劑盒的制作方法
【專(zhuān)利摘要】本發(fā)明公開(kāi)了一種牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)病PCR快速診斷試劑盒,它包括紅細(xì)胞裂解液,TBS液,蛋白酶K,裂解液,PCR酶,DL2000Marker,引物,陽(yáng)性對(duì)照,陰性對(duì)照,TE緩沖液,吸附柱。本發(fā)明研制了用于檢測(cè)牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)病PCR快速診斷試劑盒,可從牛全血臨床樣本中直接檢測(cè)到牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)病病原核酸,試劑盒的靈敏度約為41.2pg,整個(gè)檢測(cè)過(guò)程從開(kāi)始到出結(jié)果僅需6小時(shí)。由此可見(jiàn),該試劑盒具有快速、靈敏性高、特異性強(qiáng)等特點(diǎn)。適用于牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)病的檢測(cè)、診斷和流行病學(xué)調(diào)查。
【專(zhuān)利說(shuō)明】牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)病PCR快速診斷試劑盒
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001]本發(fā)明涉及一種試劑盒,尤其是一種牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)病PCR快速診斷試劑盒。【背景技術(shù)】
[0002]雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)(Babesia bigemina)病是對(duì)牛危害較大的一種血液寄生蟲(chóng)病。蟲(chóng)體經(jīng)微小牛蜱、鐮形煽頭蜱和二棘血蜱等中間宿主傳播給牛體,當(dāng)蜱叮咬牛時(shí),蟲(chóng)體隨蜱的唾液進(jìn)入牛體,隨即由血液進(jìn)入紅細(xì)胞,在紅細(xì)胞內(nèi)以“成對(duì)出芽”方式進(jìn)行繁殖。牛感染上雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)病,其臨床癥狀表現(xiàn)為稽留熱(體溫升高至40~41.5°C),病畜精神沉郁,食欲不振,腹瀉或便秘,消瘦、貧血,黏膜蒼白、黃膽,后期通常出現(xiàn)血紅蛋白尿,急性病例在4~8天內(nèi)死亡。
[0003]牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)病的流行歷史悠久,極大地威脅著養(yǎng)牛業(yè)的發(fā)展。凡是引進(jìn)純種牛、雜交牛和本地?;旌巷曫B(yǎng)放牧的場(chǎng)所,極容易發(fā)生和流行此病,如不及時(shí)治療其發(fā)病死亡率則占發(fā)病數(shù)50%~100%,這將給養(yǎng)牛生產(chǎn)帶來(lái)嚴(yán)重的損失。目前,隨著人們對(duì)乳牛制品的需求日益增長(zhǎng),草山草坡資源的綜合開(kāi)發(fā)和利用,人工草地飼養(yǎng)與發(fā)展奶牛、改良牛群數(shù)量日漸增加,該病的發(fā)生和流行日趨增加,對(duì)于確診該病,有效地控制和預(yù)防該病的發(fā)生和流行顯得尤為重要。傳統(tǒng)的診斷方法是根據(jù)臨床癥狀和血涂片光學(xué)顯微鏡檢查確診,但由于該蟲(chóng)在顯微鏡下難于與附紅體、牛巴貝斯蟲(chóng)、泰勒焦蟲(chóng)等血液原蟲(chóng)區(qū)分,這為準(zhǔn)確判斷該病造成了影響;有許多血清學(xué)方法可檢測(cè)該病原,如:補(bǔ)體結(jié)合試驗(yàn),間接免疫熒光抗體試驗(yàn),間接血凝試驗(yàn)等,但存在一定的假陽(yáng)性和假陰性,現(xiàn)在市場(chǎng)缺少一種能對(duì)牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)病臨床樣本進(jìn)行簡(jiǎn)便、快捷、靈敏、準(zhǔn)確的檢測(cè)試劑盒。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0004]本發(fā)明的目的是:提供一種牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)病PCR快速診斷試劑盒,它可以從全血臨床樣本中直接檢測(cè)到牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)病原核酸,靈敏度約為41.29pg,具有簡(jiǎn)便、快捷、靈敏、準(zhǔn)確的特點(diǎn)。
[0005]本發(fā)明是這樣實(shí)現(xiàn)的:牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)病PCR快速診斷試劑盒,它包12mL紅細(xì)胞裂解液,6mL TBS 液,1.2mL 蛋白酶 K,5.4mL 裂解液,300μ? PCR 酶,300μ? DL2000Marker, 60μ?引物,60μ?陽(yáng)性對(duì)照,330μ?陰性對(duì)照,6mL TE緩沖液,30個(gè)吸附柱;引物包括上引物及下引物,上引物及下引物的體積均為30μ?,濃度均為20 μ M ;上引物的序列為:5’ -CCCCTATCACCTTCAACC _3’,下引物序列為:5’ -ACTGCGAGCACTCAATCC -3’。
[0006]紅細(xì)胞裂解液組成包括1.5Μ NH4CL, IOOmM KHCO3 及 IOmM Na4EDTA,用 IN HCL 或 INNaOH 調(diào) pH 至 7.2-7.4。
[0007]TBS 液包括 10mmoL/L 的 Tris 含 0.9%NaCL,用 IN HCL 調(diào) pH 至 7.4。
[0008]蛋白酶K用TE溶液配制成20mg/mL。
[0009]裂解液包括IOmM的Tris-HCLUmia^ EDTA、2.5M的NaCL以及占裂解液總體積5%的SDS組成的混合溶液。[0010]TE緩沖液包括:IOmM的Tris-HCL及ImM的EDTA組成的混合溶液,混合溶液的PH值為7.8。
[0011]PCR 酶的組成包括:10mM 的 Tris-HCL (PH8.3)、50mM 的 KCL、1.5mM 的 MgCL2 以及
0.05U Polymerase/M-L。
[0012]陰性對(duì)照為超純水;陽(yáng)性對(duì)照為牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)DNA模板。
[0013]為了驗(yàn)證本發(fā)明的技術(shù)效果,進(jìn)行了以下實(shí)驗(yàn):
牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)病PCR快速診斷試劑盒的研制 材料與方法
1、參考蟲(chóng)株:牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)標(biāo)準(zhǔn)蟲(chóng)株DNA模板,由中國(guó)科學(xué)院蘭州獸醫(yī)研究所寄生蟲(chóng)病室惠贈(zèng)。附紅體、環(huán)形泰勒焦蟲(chóng)、巴貝斯焦蟲(chóng)DNA模板,均由本所重大疫病檢測(cè)室采集到的病料所提模板而得。
[0014]2、主要試劑
2.1引物(濃度為20 μ M,用TE溶液配制)
根據(jù)牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)熱休 克蛋白基因片段設(shè)計(jì)引物,PCR擴(kuò)增出一長(zhǎng)度為318bp大小的特異片段,該序列在Genbank上的登錄號(hào)為AF332567.1。引物序列如下:
上引物:5’ -CCC CTA TCA CCT TCA ACC -3,
下引物:5’ -ACT GCG AGC ACT CAA TCC -3’
由上海捷瑞生物工程有限公司合成。
[0015]2.2 PCR試劑盒的組成:⑴紅細(xì)胞裂解液;(2)TBS液;(3)蛋白酶K J4)裂解液;(5)PCR酶;(6) DL2000 Marker ;(7)引物;(8)陽(yáng)性對(duì)照;(9)陰性對(duì)照;(10) TE緩沖液;(11)吸附柱。
[0016]2.3樣本的采集
用檸檬酸鈉或EDTA作為抗凝劑無(wú)菌采集牛全血,_20°C保存?zhèn)溆谩?br>
[0017]3、模板的提取
3.1全血中DNA的提取:取1000PL全血于1.5mL的離心管中,10000r/min,離心2分鐘,去上清;用1000PL生理鹽清洗,10000r/min,離心2分鐘,去上清,采用同樣的方法共清洗3次,收集沉淀。在收集沉淀的離心管中,加入200μ?的生理鹽水和200-400μ?的紅細(xì)胞裂解液,充分搖勻,10000r/min,離心2分鐘,去上清。在離心管中加入20(^LTBS液、40μ?蛋白酶K,搖勻,再加入160μ?裂解液充分混勻,70°C水浴作用15-20分鐘,取出,加入無(wú)水乙醇200μ?,充分搖勻,然后倒入吸附柱里,離心2分鐘,去上清,加入500μ?清洗劑進(jìn)行清洗,10000r/min,離心I分鐘,反復(fù)清洗兩次,然后將倒掉了清洗劑吸附柱10000r/min,再離心2分鐘,取出吸附柱,置室溫5分鐘,將清洗劑完全晾干。再將吸附柱放入另一個(gè)干凈的收集管中,加入60-100μ?ΤΕ緩沖液,室溫放置2_5分鐘,10000r/min,離心2分鐘。為了獲得更多的DNA模板,可將離心過(guò)的溶液再加在吸附柱里,同樣室溫放置2-5分鐘,10000r/min,離心2分鐘。然后將提取得到的DNA模板用加樣槍轉(zhuǎn)入存放DNA模板的離心管里。
[0018]3.2附紅體、環(huán)形泰勒焦蟲(chóng)、巴貝斯焦蟲(chóng)DNA模板的提取,與上述方法相同。
[0019]4、牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)特異性片段的PCR擴(kuò)增
采用提取的DNA摸板,利用合成的引物在PCR酶的作用下進(jìn)行擴(kuò)增。反應(yīng)體系和條件如下:PCR酶為10μ?,雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)標(biāo)準(zhǔn)蟲(chóng)株DNA模板2μ?,樣本DNA摸板2μ?,上下引物各?μ?,加入ddH20至25μ?,在Tgradient96擴(kuò)增儀下進(jìn)行如下循環(huán):94°C變性3分鐘,94°C 35秒,53.4°C 35秒,72°C 40秒,30個(gè)循環(huán),最后72°C延伸10分鐘。反應(yīng)結(jié)束后將擴(kuò)增產(chǎn)物取7μ?進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。電泳檢測(cè)顯示約在318bp處,出現(xiàn)一條PCR目標(biāo)帶,其結(jié)果如圖1所示,與預(yù)計(jì)的結(jié)果非常接近。
[0020] 5、PCR法擴(kuò)增的特異性測(cè)定
分別用附紅體、環(huán)形泰勒焦蟲(chóng)、巴貝斯焦蟲(chóng)DNA為摸板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,除牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)出現(xiàn)擴(kuò)增帶,其它的蟲(chóng)株未見(jiàn)特異性318bp片段擴(kuò)增。結(jié)果如圖2所示。
[0021 ] 6, PCR法擴(kuò)增的敏感性的測(cè)定
采用TU-1800spc紫外可見(jiàn)光光度計(jì),取OD值為260nm,將牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)DNA摸板稀釋100倍,進(jìn)行濃度的測(cè)量。根據(jù)摸板濃度(PgZ^L)=A26tlX稀釋倍數(shù)X38/1000的方法進(jìn)行計(jì)算。測(cè)得牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)標(biāo)準(zhǔn)DNA模板的平均OD26tl值為0.05433nm,根據(jù)模板濃度的計(jì)算方法進(jìn)行計(jì)算,結(jié)果得實(shí)驗(yàn)提取的牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)標(biāo)準(zhǔn)DNA模板的含量為0.206μδ/KL。在進(jìn)行敏感性試驗(yàn)時(shí),按對(duì)數(shù)稀釋法對(duì)DNA模板進(jìn)行稀釋后,取2 PL模板進(jìn)行擴(kuò)增,則牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)標(biāo)準(zhǔn)DNA濃度依次為412ng,41.2ng,4.12ng,412pg,41.2pg,4.12pg,412fg,41.2fg,4.12fg??蓹z出的牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)標(biāo)準(zhǔn)DNA模板的含量最小是41.2pg,即靈敏度為41.2pg。結(jié)果如圖3所示。
[0022]7、重復(fù)性試驗(yàn)
應(yīng)用建立的PCR方法,重復(fù)檢測(cè)3次,檢驗(yàn)牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)DNA樣品結(jié)果的可靠性。研制結(jié)果是:應(yīng)用建立的PCR方法,重復(fù)檢測(cè)牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)DNA樣品3次結(jié)果均一致。
[0023]8、試劑盒的保存期檢測(cè)
將試劑盒在4°C、一 20°C分別保存I個(gè)月、3個(gè)月、6個(gè)月、I年,對(duì)陽(yáng)性樣品進(jìn)行檢測(cè),以確定試劑盒的保存時(shí)間。研制結(jié)果是:4°C保存I年條帶較淡,一 20°C保存I個(gè)月、3個(gè)月、6個(gè)月、I年對(duì)條帶亮度無(wú)影響。
[0024]由于采用了上述技術(shù)方案,本發(fā)明研制了用于檢測(cè)牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)病的PCR試劑盒,可從牛全血臨床樣本中直接檢測(cè)到牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)病原核酸,試劑盒的靈敏度為41.2pg,從開(kāi)始到出結(jié)果整個(gè)檢測(cè)過(guò)程僅需6小時(shí)。由此可見(jiàn),該試劑盒具有快速、靈敏性高、特異性強(qiáng)等特點(diǎn)。適用于牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)病的檢測(cè)、診斷和流行病學(xué)調(diào)查。
【專(zhuān)利附圖】
【附圖說(shuō)明】
[0025]附圖1為牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)特異性片段試驗(yàn)圖;
M.Marker DL2000 ;1.標(biāo)準(zhǔn)陰性;2.標(biāo)準(zhǔn)陽(yáng)性;3.被檢出的陽(yáng)性樣本;
附圖2為PCR特異性試驗(yàn)圖;
M.Marker DL2000 ;1.牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng);2.附紅體;3.環(huán)形泰勒焦蟲(chóng);4.巴貝斯焦
蟲(chóng);
附圖3為PCR敏感性 試驗(yàn)圖;
M.Marker DL2000 ;1.DNA 模板為 412ng ;2.DNA 模板為 41.2ng ;3.DNA 模板為 4.12ng ;4.DNA 模板為 412pg ;5.DNA 模板為 41.2pg ;6.DNA 模板為 4.12pg ;7.DNA 模板為 412fg ;8.DNA 模板為 41.2fg。
【具體實(shí)施方式】[0026]本發(fā)明的實(shí)施例:牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)病PCR快速診斷試劑盒,它包12mL紅細(xì)胞裂解液,6mL TBS 液,L2mL 蛋白酶 K,5.4mL 裂解液,300μ? PCR 酶,300μ? DL2000 Marker,60μ?引物,60μ?陽(yáng)性對(duì)照,330μ?陰性對(duì)照,6mL TE緩沖液,30個(gè)吸附柱;引物包括上引物及下引物,上引物及下引物的體積均為30μ?,濃度均為20μΜ;上引物的序列為:5’-CCCCTATCACCTTCAACC _3’,下引物序列為:5’ -ACTGCGAGCACTCAATCC -3’;紅細(xì)胞裂解液組成包括 1.5Μ NH4CL, IOOmM KHCO3 及 IOmM Na4EDTA,用 IN HCl 或 IN NaOH 調(diào) pH 至
7.2-7.4 ;TBS 液包括 10mmoL/L 的 Tris 含 0.9%NaCL,用 IN HCl 調(diào) pH 至 7.4 ;蛋白酶 K 用TE溶液配制成20mg/mL ;裂解液包括IOmM的Tris-HCL、ImM的EDTA、2.5M的NaCL以及占裂解液總體積5%的SDS組成的混合溶液;TE緩沖液包括:10mM的Tris-HCL及ImM的EDTA組成的混合溶液,混合溶液的PH值為7.8 ;PCR酶的組成包括:10mM的Tris-HCL (PH8.3)、50mM的KCL、1.5mM的MgCL2以及0.05U Polymerase/^L ;陰性對(duì)照為超純水;陽(yáng)性對(duì)照為牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)DNA模板。
[0027]本發(fā)明中,M表示摩爾濃度單位,即是moL/L ;mM毫摩爾濃度單位,即是mmoL/L,N的當(dāng)量濃度單位。
[0028]試劑盒中通常還配備清洗劑,清洗劑的用量是30mL,一般可以自己配制,成分是質(zhì)量百分比為70%的 乙醇。
【權(quán)利要求】
1.一種牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)病PCR快速診斷試劑盒,其特征在于:它包12mL紅細(xì)胞裂解液,6mL TBS 液,1.2mL 蛋白酶 K,5.4mL 裂解液,300μl PCR 酶,300μ? DL2000 Marker,.60μl引物,60μ?陽(yáng)性對(duì)照,330μ?陰性對(duì)照,6mL TE緩沖液,30個(gè)吸附柱;引物包括上引物及下引物,上引物及下引物的體積均為30μ?,濃度均為20μΜ;上引物的序列為:.5’ -CCCCTATCACCTTCAACC -3’,下引物序列為:5’ -ACTGCGAGCACTCAATCC -3’。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)病PCR快速診斷試劑盒,其特征在于:紅細(xì)胞裂解液組成包括 1.5Μ NH4CL, IOOmM KHCO3 及 IOmM Na4EDTA,用 IN HCL 或 IN NaOH調(diào) pH至 7.2-7.4。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)病PCR快速診斷試劑盒,其特征在于:TBS液包括 10mmoL/L 的 Tris 含 0.9%NaCL,用 IN HCL 調(diào) pH 至 7.4。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)病PCR快速診斷試劑盒,其特征在于:蛋白酶K用TE溶液配制成20mg/mL。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)病PCR快速診斷試劑盒,其特征在于:裂解液包括IOmMTris-HCL、lmMEDTA、2.5M NaCL以及占裂解液總體積5%的SDS組成的混合溶液。
6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)病PCR快速診斷試劑盒,其特征在于:TE緩沖液包括=IOmM的Tris-HCL及ImM的EDTA組成的混合溶液,混合溶液的PH值為7.8。
7.根據(jù)權(quán)利要求1所述的牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)病PCR快速診斷試劑盒,其特征在于:PCR 酶的組成包括:10mM 的 Tris-HCL (PH8.3)、50mM 的 KCL、1.5mM 的 MgCL2 以及 0.05UPolymerase/M-L 。
8.根據(jù)權(quán)利要求1所述的牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)病PCR快速診斷試劑盒,其特征在于:陰性對(duì)照為超純水;陽(yáng)性對(duì)照為牛雙芽巴貝斯焦蟲(chóng)DNA模板。
【文檔編號(hào)】C12Q1/68GK103509873SQ201310502734
【公開(kāi)日】2014年1月15日 申請(qǐng)日期:2013年10月23日 優(yōu)先權(quán)日:2013年10月23日
【發(fā)明者】吳位珩, 孫啟躍, 楊莉, 文才智, 張劍剛, 楊茂生 申請(qǐng)人:貴州省畜牧獸醫(yī)研究所