技術(shù)特征：

1.一種合成生物益生菌的篩選方法，其特征在于，包括以下步驟：

2.如權(quán)利要求1所述的合成生物益生菌的篩選方法，其特征在于，所述將前k位堿基相同的k-mer的頻率按照k-mer剩余部分堿基字母順序依次放入到一個(gè)集合中，具體為：

3.如權(quán)利要求1所述的合成生物益生菌的篩選方法，其特征在于，所述通道注意力模塊，具體包括：

4.如權(quán)利要求1所述的合成生物益生菌的篩選方法，其特征在于，所述通道注意力模塊，具體包括：

5.如權(quán)利要求3或4所述的合成生物益生菌的篩選方法，其特征在于，所述將所述通道權(quán)重向量和通道注意力向量融合，具體為：

6.一種合成生物益生菌的篩選系統(tǒng)，其特征在于，包括以下模塊：

7.如權(quán)利要求6所述的合成生物益生菌的篩選系統(tǒng)，其特征在于，所述將前k位堿基相同的k-mer的頻率按照k-mer剩余部分堿基字母順序依次放入到一個(gè)集合中，具體為：

8.如權(quán)利要求6所述的合成生物益生菌的篩選系統(tǒng)，其特征在于，所述通道注意力模塊，具體包括：

9.如權(quán)利要求6所述的合成生物益生菌的篩選系統(tǒng)，其特征在于，所述通道注意力模塊，具體包括：

10.一種計(jì)算機(jī)存儲(chǔ)設(shè)備，所述存儲(chǔ)設(shè)備上存儲(chǔ)有計(jì)算機(jī)程序，其特征在于，所述計(jì)算機(jī)程序在被處理器執(zhí)行時(shí)實(shí)現(xiàn)如權(quán)利要求1-5任一項(xiàng)所述的方法。

技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明屬于合成生物益生菌篩選技術(shù)領(lǐng)域，具體為一種合成生物益生菌的篩選方法及系統(tǒng)，搜索DNA序列中的目標(biāo)區(qū)域，統(tǒng)計(jì)目標(biāo)區(qū)域中的K?mer頻率，將前k位堿基相同的K?mer的頻率按照K?mer剩余部分堿基字母順序依次放入到一個(gè)集合中，將所有集合按照前k位堿基字母順序按行拼接為目標(biāo)區(qū)域的頻率特征矩陣，將所有目標(biāo)區(qū)域的頻率特征矩陣構(gòu)成多通道頻率特征矩陣，將多通道頻率特征矩陣輸入到具有通道注意力模塊的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型中進(jìn)行訓(xùn)練；從待篩選的合成生物益生菌的DNA序列得到待篩選的合成生物益生菌的多通道頻率特征矩陣，將多通道頻率特征矩陣輸入到訓(xùn)練后的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型中得到合成生物益生菌的得分。本發(fā)明能夠提高合成生物益生菌初篩的效率。

技術(shù)研發(fā)人員：林滿,華曉曼,劉明剛
受保護(hù)的技術(shù)使用者：山東合成生物技術(shù)有限公司
技術(shù)研發(fā)日：
技術(shù)公布日：2025/1/6